益生元是益生菌的食物，一般难以被人体吸收，能够促进体内益生菌的增殖，为益生菌提供营养支持。卓岳宜君素包含9大益生元：
低聚异麦芽糖
能够被肠道有益菌双歧杆菌优先利用，使其增殖，从而使双歧杆菌在肠道内成为优势菌落。
菊粉
萃取自菊苣，属于可溶性膳食纤维。菊粉产生热量很少，有一定甜度，但不会被人体吸收而影响血糖水平。菊粉有膳食纤维和益生元双重作用。菊粉被人体摄入后，不能被吸收，但会被结肠中的双歧杆菌、乳酸菌发酵，从而促进肠道益生菌的产生，具有双歧杆菌增殖因子的作用。
抗性糊精
是一种重要的功能性膳食纤维，大部分都在肠道中被发酵，能增加肠道中乳酸杆菌和α、β-葡萄糖苷酶的量，并降低粪便的pH值。绝大部分抗性糊精最终都会进入大肠，能促进包括双歧杆菌、干酪乳杆菌在内的多种肠道益生菌群的生长繁殖。
水苏糖
水苏糖不会在人体胃肠道内降解，而是直接到达肠道，被肠道内的有益菌如双歧杆菌、乳酸杆菌等利用，通过改善肠道微生态而发挥功能活性。少量水苏糖即可被微生物有效利用。
低聚果糖
又称FOS。天然低聚果糖存在于多种植物或水果中，如菊苣、菊芋、香蕉、洋葱及雪莲果等。低聚果糖可以增加人体肠道内双歧杆菌的数量，从而调节肠道菌群。
乳糖醇
乳糖醇具有清爽无后味类似蔗糖的口感，甜度约为相同浓度蔗糖的40%。众多研究表明，乳糖醇能够显著促进肠道有益菌的生长，而不会被有害菌利用，可以归为益生元。
聚葡萄糖
在胃肠道上半部分并不被消化，只是到了胃肠道的下半部分被发酵，这有利于肠道有益菌（双歧杆菌、乳杆菌）的繁殖，并抑制有害菌如：梭状芽孢杆菌和拟杆菌。
低聚甘露糖
作为益生元进入人体肠道，被拟杆菌和乳酸菌利用，可促进拟杆菌和乳酸菌的增殖。低聚甘露糖具有低热值、低甜度、不引发龋齿、不升高血糖等特点。
低聚木糖
是一种非消化性寡糖，具有很好的温度稳定性和抗酸性,进入消化系统后不能被胃酸和小肠液所消化，低聚木糖进入肠道后能被肠道中有益菌利用，促进有益菌生长，尤其对双歧杆菌和乳酸杆菌等产酸的有益菌具有高选择性增殖作用，且对有害菌有抑制作用。